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上海市食源性金黄色葡萄球菌肠毒素基因多样性及分型研究
作 者: 李自然
导 师: 史贤明
学 校: 上海交通大学
专 业: 食品科学
关键词: 金黄色葡萄球菌 分离鉴定 食品 肠毒素 MLST
分类号: R155.5
类 型: 硕士论文
年 份: 2012年
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内容摘要
本研究从上海市各农贸市场及超市采集各类食品样品,按GB4789.10-2010进行金黄色葡萄球菌的分离及鉴定工作,并用PCR方法进一步鉴定,以减少假阳性,最终获得金黄色葡萄球菌食品分离株;同时提取金黄色葡萄球菌食品分离株的DNA,PCR检测其肠毒素基因的多样性,统计分析各种肠毒素基因的分布情况;最后对金黄色葡萄球菌食品分离株进行多位点序列分型(MLST)研究。首先采集食品样品(生牛奶,生鲜肉,水产品、速冻食品、果蔬、豆制品)505份,按国标方法进行金黄色葡萄球菌的分离和鉴定,共检出被金黄色葡萄球菌污染的食品样品117份,分离金黄色葡萄球菌183株,总检出率为23.2%。在不同种类食品样品中,金黄色葡萄球菌的检出率存在明显差异,其中生鲜肉样品检出率最高,为32.9%;其次为生牛乳和速冻食品,检出率分别为26.3%和26.7%;其它食品中金黄色葡萄球菌的检出率相对较低。该实验结果基本上反映了上海市各类食品中金黄色葡萄球菌的污染状况,为监控金黄色葡萄球菌引起的食物中毒及追溯污染源提供了参考依据。其次,鉴于金黄色葡菌球菌肠毒素是金黄色葡萄球菌引起食物中毒的主要原因,本实验应用PCR技术检测金黄色葡萄球菌食品分离株肠毒素基因的分布特征。在183株金黄色葡萄球菌食品分离株中,有161株携带肠毒素基因,携带率为88.0%;22株金黄色葡萄球菌不携带所检测的18种肠毒素基因,占12.0%;携带率最高的肠毒素基因是seb和sem,均为48.1%;携带率最低的肠毒素基因为see,未检出;5种传统肠毒素基因的携带率(67.8%)低于新型肠毒素基因的携带率(84.7%);含有egc毒力基因簇(同时携带肠毒素基因seg、sei、sem、sen、seo或seg、sei、sem、sen、seu)的分离株有28株,占15.3%;同时携带2种及以上肠毒素基因的分离株有141株,占所有菌株的77.0%,占携带肠毒素基因菌株的87.0%;携带10种以上肠毒素基因的菌株有9株,占全部分离株的4.9%。最后,为鉴别菌株间的相关性,进一步确定菌株特征,进行金黄色葡萄球菌食品分离株的MLST分型研究。研究发现,183株金黄色葡萄球菌食品分离株中,共有22个序列型,其中数量最多的序列型为ST-188,有101株;其次为ST-2094和ST-7,分别有22株和20株;ST-97、ST-5、ST-1281、ST-398和ST-1等也比较常见;同时发现,不同种类食品中序列型的分布不同,如金黄色葡萄球菌生鲜肉分离株中:最主要的序列型为ST-7,有19株;其次为ST-188,有7株;ST-2094、ST-5等也比较常见;而在金黄色葡萄球菌生牛乳分离株中,最主要的序列型为ST-188,有67株;其次为ST-2094,有15株;ST-97、ST-965、ST-9等也比较常见。金黄色葡萄球菌果蔬及速冻食品分离株中,最多的序列型是ST-188。金黄色葡萄球菌豆制品分离株中,出现的序列型包括ST-15、ST-5、ST-512、ST-188和ST-2094。在金黄色葡萄球菌水产品分离株(共6株)中,序列型分别为ST-2094、ST-6、ST-72、ST-88和ST-50。
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全文目录
摘要 6-9 ABSTRACT 9-12 英文缩略语索引 12-15 第一章 绪论 15-25 1.1 金黄色葡萄球菌生物学特性及其危害性 15-18 1.1.1 金黄色葡萄球菌生物学特性 15 1.1.2 金黄色葡萄球菌的流行病学特征 15-17 1.1.3 金黄色葡萄球菌的致病性 17-18 1.1.4 金黄色葡萄球菌分离鉴定方法 18 1.2 金黄色葡萄球菌肠毒素基因检测研究进展 18-21 1.2.1 金黄色葡萄球菌肠毒素 18-19 1.2.2 金黄色葡萄球菌肠毒素基因的多样性 19-20 1.2.3 金黄色葡萄球菌肠毒素基因检测方法 20-21 1.3 金黄色葡萄球菌分型研究进展 21-24 1.3.1 金黄色葡萄球菌分型方法 21-22 1.3.2 多位点测序分型(MLST) 22-24 1.4 立题意义及研究内容 24-25 第二章 食品中金黄色葡萄球菌的分离鉴定 25-39 2.1 材料和方法 25-31 2.1.1 样品来源 25 2.1.2 仪器 25-26 2.1.3 主要试剂及配置 26-27 2.1.4 培养基 27-28 2.1.5 标准菌株 28 2.1.6 金黄色葡萄球菌的分离及鉴定 28-29 2.1.7 金黄色葡萄球菌基因组DNA 的提取 29-30 2.1.8 PCR 方法验证 30-31 2.2 结果与分析 31-38 2.2.1 分离及鉴定 31-36 2.2.2 金黄色葡萄球菌在各类样品中的污染状况 36-38 2.3 讨论 38-39 第三章 金黄色葡萄球菌肠毒素基因多样性的分析检测 39-50 3.1 材料和方法 39-44 3.1.1 仪器 39-40 3.1.2 试剂 40-41 3.1.3 菌株 41 3.1.4 培养基 41 3.1.5 方法 41-44 3.2 结果与分析 44-48 3.2.1 18 种肠毒素基因检出情况 44-46 3.2.2 金黄色葡萄球菌食品分离株肠毒素基因分布 46-48 3.3 讨论 48-50 第四章 金黄色葡萄球菌多位点序列分型研究 50-64 4.1 材料和方法 50-59 4.1.1 仪器 50-51 4.1.2 试剂 51-52 4.1.3 金黄色葡萄球菌食品分离株 52 4.1.4 方法 52-59 4.2 结果与分析 59-61 4.2.1 金黄色葡萄球菌MLST 序列多样性 59-60 4.2.2 不同种类食品来源的金黄色葡萄球菌分离株分型情况 60 4.2.3 金黄色葡萄球菌MLST 分型与肠毒素基因相关性 60-61 4.3 讨论 61-64 第五章 总结与展望 64-68 5.1 主要结论 64-65 5.2 特色和创新 65-66 5.3 展望 66-68 参考文献 68-75 附录1 75-82 附录2 82-91 致谢 91-92 攻读学位期间发表的学术论文 92
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中图分类: > 医药、卫生 > 预防医学、卫生学 > 营养卫生、食品卫生 > 饮食卫生与食品检查 > 食品卫生与检验
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