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马氏珠母贝选育系遗传结构的SSR分析

作 者: 朱文杰
导 师: 杜晓东
学 校: 广东海洋大学
专 业: 海洋生物学
关键词: 马氏珠母贝 金黄壳色选育系F2 家系 微卫星 遗传结构
分类号: S917.4
类 型: 硕士论文
年 份: 2010年
下 载: 46次
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内容摘要


1、利用微卫星分子标记分析了金黄壳色选育系F2和对照群体的遗传结构与遗传分化。结果表明:利用6对引物共检测出34个等位基因,平均每个位点产生6.667个,每个位点的等位基因数为4-7不等;金黄壳色选育系F2和对照群体的平均有效等位基因数分别为1.6433和1.8356,平均表观杂合度分别为0.3854和0.4792,平均期望杂合度分别为0.3754和0.4429,平均多态信息含量分别为0.6660和0.7153;平均遗传分化系数为0.0279。研究结果表明,金黄壳色选育系F2和对照群体的遗传多样性处于中等水平,呈中度遗传分化。2、利用微卫星分子标记分析了4个金黄壳色家系的遗传结构与遗传分化,结果表明:利用7对引物共检测出32个等位基因,平均每个位点产生4.571个,每个位点的等位基因数为2-8不等。4个家系的平均有效等位基因频率在1.8122-2.0896之间,平均表观杂合度在0.3400-0.3654之间,平均期望杂合度在0.2757-0.3538之间,平均多态信息含量PIC在0.5024-0.5670之间;Shannon多样性指数在0.7184-0.8103之间;家系间遗传距离在0.0306-0.1649之间,遗传分化系数平均值为0.0627。研究结果表明,4个家系具有较高的遗传多样性,而且4个家系间出现中度遗传分化。

全文目录


摘要  5-6
ABSTRACT  6-9
1 前言  9-16
  1.1 马氏珠母贝简介及其研究现状  9-12
    1.1.1 马氏珠母贝简介  9
    1.1.2 马氏珠母贝育种研究现状  9-11
    1.1.3 马氏珠母贝的分子标记育种  11-12
  1.2 微卫星分子标记技术  12-15
    1.2.1 微卫星分子标记技术的原理及其特性  12-13
    1.2.2 微卫星DNA 的检测  13
    1.2.3 微卫星分子标记技术在贝类遗传育种中的应用  13-15
  1.3 本论文的研究目的和意义  15-16
2 马氏珠母贝选育系 F2 遗传结构的 SSR 分析  16-32
  2.1 材料与方法  16-22
    2.1.1 技术路线  16
    2.1.2 材料来源  16-17
    2.1.3 实验仪器与试剂  17-18
    2.1.4 实验方法  18-22
  2.2 结果与分析  22-28
    2.2.1 基因组DNA 检测  22
    2.2.2 PCR 产物检测  22-28
    2.2.3 选育系内的遗传多样性  28
    2.2.4 选育系间的遗传多样性  28
    2.2.5 选育系间的遗传分化  28
  2.3 讨论  28-32
    2.3.1 选育系的遗传变异  28-29
    2.3.2 选育系的遗传分化  29-30
    2.3.3 金黄壳色选育系F2的遗传结构分析  30-32
3 马氏珠母贝4 个家系的遗传多样性分析  32-43
  3.1 材料与方法  32
    3.1.1 技术路线  32
    3.1.2 材料来源  32
    3.1.3 实验方法  32
  3.2 结果与分析  32-41
    3.2.1 基因组DNA 检测  32
    3.2.2 PCR 产物的聚丙烯酰胺凝胶电泳检测  32-36
    3.2.3 群体内的遗传多样性  36-40
    3.2.4 遗传距离与聚类分析  40-41
  3.3 讨论  41-43
    3.3.1 家系间的遗传多样性分析  41-42
    3.3.2 家系间的近交与遗传分化  42
    3.3.3 微卫星标记检测的样本容量  42-43
4 总结  43-44
参考文献  44-50
致谢  50-51
作者简介  51-52
导师简介  52-53
附录  53-57

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中图分类: > 农业科学 > 水产、渔业 > 水产基础科学 > 水产生物学 > 水产动物学
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