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马氏珠母贝选育系遗传结构的SSR分析
作 者: 朱文杰
导 师: 杜晓东
学 校: 广东海洋大学
专 业: 海洋生物学
关键词: 马氏珠母贝 金黄壳色选育系F2 家系 微卫星 遗传结构
分类号: S917.4
类 型: 硕士论文
年 份: 2010年
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内容摘要
1、利用微卫星分子标记分析了金黄壳色选育系F2和对照群体的遗传结构与遗传分化。结果表明:利用6对引物共检测出34个等位基因,平均每个位点产生6.667个,每个位点的等位基因数为4-7不等;金黄壳色选育系F2和对照群体的平均有效等位基因数分别为1.6433和1.8356,平均表观杂合度分别为0.3854和0.4792,平均期望杂合度分别为0.3754和0.4429,平均多态信息含量分别为0.6660和0.7153;平均遗传分化系数为0.0279。研究结果表明,金黄壳色选育系F2和对照群体的遗传多样性处于中等水平,呈中度遗传分化。2、利用微卫星分子标记分析了4个金黄壳色家系的遗传结构与遗传分化,结果表明:利用7对引物共检测出32个等位基因,平均每个位点产生4.571个,每个位点的等位基因数为2-8不等。4个家系的平均有效等位基因频率在1.8122-2.0896之间,平均表观杂合度在0.3400-0.3654之间,平均期望杂合度在0.2757-0.3538之间,平均多态信息含量PIC在0.5024-0.5670之间;Shannon多样性指数在0.7184-0.8103之间;家系间遗传距离在0.0306-0.1649之间,遗传分化系数平均值为0.0627。研究结果表明,4个家系具有较高的遗传多样性,而且4个家系间出现中度遗传分化。
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全文目录
摘要 5-6 ABSTRACT 6-9 1 前言 9-16 1.1 马氏珠母贝简介及其研究现状 9-12 1.1.1 马氏珠母贝简介 9 1.1.2 马氏珠母贝育种研究现状 9-11 1.1.3 马氏珠母贝的分子标记育种 11-12 1.2 微卫星分子标记技术 12-15 1.2.1 微卫星分子标记技术的原理及其特性 12-13 1.2.2 微卫星DNA 的检测 13 1.2.3 微卫星分子标记技术在贝类遗传育种中的应用 13-15 1.3 本论文的研究目的和意义 15-16 2 马氏珠母贝选育系 F2 遗传结构的 SSR 分析 16-32 2.1 材料与方法 16-22 2.1.1 技术路线 16 2.1.2 材料来源 16-17 2.1.3 实验仪器与试剂 17-18 2.1.4 实验方法 18-22 2.2 结果与分析 22-28 2.2.1 基因组DNA 检测 22 2.2.2 PCR 产物检测 22-28 2.2.3 选育系内的遗传多样性 28 2.2.4 选育系间的遗传多样性 28 2.2.5 选育系间的遗传分化 28 2.3 讨论 28-32 2.3.1 选育系的遗传变异 28-29 2.3.2 选育系的遗传分化 29-30 2.3.3 金黄壳色选育系F2的遗传结构分析 30-32 3 马氏珠母贝4 个家系的遗传多样性分析 32-43 3.1 材料与方法 32 3.1.1 技术路线 32 3.1.2 材料来源 32 3.1.3 实验方法 32 3.2 结果与分析 32-41 3.2.1 基因组DNA 检测 32 3.2.2 PCR 产物的聚丙烯酰胺凝胶电泳检测 32-36 3.2.3 群体内的遗传多样性 36-40 3.2.4 遗传距离与聚类分析 40-41 3.3 讨论 41-43 3.3.1 家系间的遗传多样性分析 41-42 3.3.2 家系间的近交与遗传分化 42 3.3.3 微卫星标记检测的样本容量 42-43 4 总结 43-44 参考文献 44-50 致谢 50-51 作者简介 51-52 导师简介 52-53 附录 53-57
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中图分类: > 农业科学 > 水产、渔业 > 水产基础科学 > 水产生物学 > 水产动物学
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