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不结球白菜遗传图谱的构建及Vc性状的QTL定位

作　者: 单晓政
导　师: 李英
学　校: 南京农业大学
专　业: 蔬菜学
关键词: 不结球白菜 体系优化 分子遗传图谱 Vc性状 QTL定位
分类号: S634.3
类　型: 硕士论文
年　份: 2009年
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内容摘要


不结球白菜(Brassica campestris ssp. chinensis Makino)原产中国,是东亚地区重要的蔬菜作物之一,在日常生活中占有重要地位。本研究优化了不结球白菜SRAP反应体系,构建了ISSR、RAPD、SSR、SRAP分子标记连锁遗传图谱,并在此基础上进行了不结球白菜Vc性状QTL定位。主要研究结果如下：1.通过单因素试验确定了Mg2+、dNTP、TaqDNA聚合酶和引物4种因素在不结球白菜SRAP反应体系中的适宜浓度范围,并在此基础上利用正交试验设计,从4种因素3个水平对不结球白菜SRAP反应体系进行了优化,确立了适合不结球白菜的SRAP反应体系,25μL反应体系中,含Mg2+2 mmol／L、dNTP 0.2mmol／L、TaqDNA聚合酶1.5U、引物0.36μmol／L、1×PCR buffer、模板DNA 30ng。2.以不结球白菜高Vc含量品种‘常州乌塌菜’和低Vc含量品种‘二青’杂交产生的181株F2代分离材料为作图群体,利用ISSR、RAPD、SSR、SRAP四种分子标记来构建不结球白菜分子遗传连锁图谱。结果表明,构建的连锁图谱包含11个连锁组群,由138个标记组成的连锁图谱,其中包括4个ISSR标记、19个RAPD标记、22个SSR标记和93个SRAP标记。其中偏分离标记36个,占26.1%。每条连锁群上的标记数在4～33个之间,连锁群长度在53～164cM的范围,覆盖基因组945cM,总平均图距6.8cM。3.利用已构建的包括138个分子标记的不结球白菜分子遗传图谱,采用复合区间作图法(CIM)对不结球白菜叶片Vc性状进行了QTL定位和遗传效应分析。取LOD临界值为2.5,得到控制Vc性状的QTL 2个,分别位于第3和第4连锁群上,单个QTL贡献率分别为4.74%和7.63%。本研究定位的不结球白菜Vc性状的QTL是首次报道,这将为不结球白菜Vc性状分子标记辅助选择育种奠定基础。

全文目录


摘要  6-7
ABSTRACT  7-9
缩略词表  9-10
引言  10-11
第一章 文献综述  11-33
  1.DNA分子标记  11-16
    1.1 RFLP  11-12
    1.2 RAPD  12-13
    1.3 SSR  13
    1.4 SRAP  13-14
    1.5 ISSR  14
    1.6 TRAP  14
    1.7 RGAP  14-15
    1.8 AFLP  15
    1.9 CAPS  15-16
    1.10 SNP  16
  2.基因组图谱  16-21
    2.1 遗传图谱  16-20
    2.2 物理图谱  20
    2.3 比较图谱研究  20-21
  3.QTL定位的方法、原理及研究进展  21-25
    3.1 QTL定位的方法与原理  21-23
    3.2 QTL定位的最新研究概况  23-24
    3.3 白菜类QTL定位研究进展  24-25
  4.作物分子标记辅助选择育种研究的进展与展望  25-27
    4.1 质量性状的标记辅助选择  25-26
    4.2 数量性状的标记辅助选择  26
    4.3 MAS存在的问题与展望  26-27
  参考文献  27-33
第二章 不结球白菜SRAP体系优化  33-43
  1.材料与方法  34-36
    1.1 材料  34
    1.2 SRAP-PCR产物扩增  34
    1.3 基因组DNA的提取  34-35
    1.4 SRAP扩增反应单因素筛选  35
    1.5 正交试验优化SRAP—PCR体系  35-36
    1.6 扩增产物检测方法的比较  36
  2.结果与分析  36-39
    2.1 SRAP扩增反应单因素筛选  36-38
    2.2 SRAP反应体系的正交优化  38-39
  3.SRAP扩增产物检测方法的比较  39-40
  4.讨论  40
  参考文献  40-43
第三章 不结球白菜分子遗传图谱的构建  43-57
  1.材料与方法  44-48
    1.1 群体的构建  44
    1.2 方法  44-48
  2.结果与分析  48-52
    2.1 分子标记的多态性分析  48-50
    2.2 遗传图谱的构建  50-52
    2.3 偏分离分析  52
  3.讨论  52-54
  参考文献  54-57
第四章 不结球白菜Vc性状的QTL定位  57-65
  1.材料与方法  58-59
    1.1 材料  58
    1.2 方法  58-59
  2.结果与分析  59-61
    2.1 Vc性状的QTL分析  59-61
  3.讨论  61-62
  参考文献  62-65
全文结论  65-67
论文发表情况  67-69
致谢  69

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中图分类: > 农业科学 > 园艺 > 蔬菜园艺 > 白菜类 > 白菜（小白菜）
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