学位论文 > 优秀研究生学位论文题录展示

3D-FISH图像的量化处理和统计分析

作　者: 杨寻
导　师: 马万云
学　校: 清华大学
专　业: 物理学
关键词: 3D-FISH 图像量化处理图像自动分割易位型21三体 M2b亚型白血病
分类号: TP391.41
类　型: 硕士论文
年　份: 2013年
下　载: 9次
引　用: 0次
阅　读: 论文下载

内容摘要

细胞中染色体的空间构象与染色体的密度、基因转录活跃程度，以及细胞核的功能有关，对研究癌症、遗传病等疾病的发病机理有重要意义。3D-FISH技术是研究染色体空间构象的重要手段，结合共聚焦激光扫描显微镜成像技术，能获取细胞内染色体三维的原位荧光图像。对图像依次进行三级处理（低级、中级和高级处理）后，可以实现图像的量化和统计分析，得出细胞内染色体三维构象规律。本文简要介绍3D-FISH和共聚焦激光扫描显微成像技术，深入介绍三维图像的量化处理和统计分析方法。并实际应用在2个病例——易位型21三体患者的21#和14#染色体的空间构象、M2b亚型白血病的8#和21#染色体的空间构象。文中还对图像处理中的难点——图像分割，进行了较深入的研究，并尝试在Matlab环境下编写三维图像自动分割程序，使这个难点得到初步解决。

全文目录

摘要  3-4
Abstract  4-7
第1章引言  7-14
  1.1 研究染色体构象的意义  7-12
  1.2 3D-FISH 简介  12
  1.3 3D-FISH 的应用  12-13
  1.4 本文内容  13-14
第2章 3D-FISH 实验原理和成像方法  14-17
  2.1 3D-FISH 实验原理  14
  2.2 成像方法-共焦激光扫描显微镜  14-17
第3章图像处理及量化  17-25
  3.1 低级处理  17-20
    3.1.1 空间滤波  17-20
    3.1.2 去卷积  20
  3.2 中级处理  20-24
    3.2.1 图像分割算法  21-22
    3.2.2 量化参数的选取  22-24
    3.2.3 量化参数的提取  24
  3.3 高级处理  24-25
第4章三维图像自动分割方法探索  25-34
  4.1 三维图像自动处理软件 Nemo 简介  25-29
  4.2 Matlab 环境下三维图像自动分割方法探索  29-34
    4.2.1 二维图像自动分割  29-31
    4.2.2 三维图像自动分割  31-34
第5章统计分析方法  34-39
  5.1 作分布直方图  34-35
  5.2 差异显著性检测  35-39
    5.2.1 非配对设计两样本均数差异显著性检验  35-39
第6章 3D-FISH 应用实例  39-65
  6.1 易位型 21 三体病例  39-48
    6.1.1 易位型 21 三体  39-40
    6.1.2 3D-FISH 图像处理  40-41
    6.1.3 量化参数及量化分析  41-47
    6.1.4 小结  47-48
  6.2 M2b 亚型白血病治疗后病例  48-65
    6.2.1 骨髓细胞对比  52-57
    6.2.2 血液细胞对比  57-62
    6.2.3 骨髓-血液对比  62-63
    6.2.4 粘连度分析——骨髓重叠型细胞和血液重叠型细胞粘连度  63-64
    6.2.5 小结  64-65
第7章结论和展望  65-67
  7.1 本文总结  65
  7.2 展望  65-67
    7.2.1 图像分割方面  65
    7.2.2 统计分析方面  65-67
参考文献  67-70
致谢  70-72
附录 A Matlab 环境下三维图像自动分割代码  72-80
个人简历、在学期间发表的学术论文与研究成果  80

3D-FISH图像的量化处理和统计分析

内容摘要

全文目录

相似论文