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肺炎链球菌感染猕猴肠道菌群分子解析及消化、呼吸、免疫系统免疫相关因子的表达
作 者: 罗启慧
导 师: 程安春
学 校: 四川农业大学
专 业: 预防兽医学
关键词: 肠道菌群 分子解析 IL-6 IL-2 sIgA IFN-γ CD3 肺炎链球菌 猕猴
分类号: S858.9
类 型: 博士论文
年 份: 2012年
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内容摘要
肺炎链球菌是社区获得性肺炎最重要的致病原之一,为了进一步研究肺炎链球菌的致病机理,本实验对疑似感染肺炎链球菌猕猴进行解剖,并进行了微生物分离鉴定。同时采用H.E染色法对自发感染肺炎链球菌的猕猴消化系统、呼吸系统和免疫系统进行了组织病理学观察。肠道菌群在宿主的营养、代谢和宿主免疫保护等方面都起着非常重要的作用,而很多疾病的发生、发展也与肠道菌群结构的变化有着密切的联系。本论文对感染肺炎链球菌的猕猴和健康猕猴,采用不同类型分子生态学的方法研究了猕猴肠道菌群的组成变化。在此基础上,本实验以自发性感染肺炎链球菌猕猴为实验对象,采用免疫组织化学方法检测各系统在感染前后IL-6、IL-2、sIgA、IFN-y以及CD3蛋白质的表达情况。得到了如下实验结果:1、微生物分离鉴定结果:从心、肝、脾、肺组织及血液中分离到草绿色溶血菌株;胆汁溶菌实验和optochin实验结果表明分离菌株为肺炎链球菌,且为optochin敏感菌株;小鼠毒力实验结果表明本分离株对小鼠致病力强,为肺炎链球菌强毒株;16S rRNA序列分析表明与肺炎链球菌同源性高达99%以上,从分子水平上证实本实验分离到肺炎链球菌。结果表明本实验中采用的猕猴为强毒肺炎链球菌菌株感染猕猴。2、病理组织学结果:发现淋巴结出现大量巨噬细胞及粒细胞;脾血窦间隙增大,淋巴细胞增多;肺脏和气管均发生明显出血,肺泡隔增厚,有大量炎性细胞浸润;肝组织有广泛性的出血,部分肝细胞发生变性坏死;胃肠道黏膜层的腺体细胞发生广泛性的变性、坏死,腺体萎缩、结构破坏,黏膜层淋巴细胞大量增加;食管无明显病变。研究结果表明肺炎链球菌感染组猕猴出现了较为典型的组织病理学变化。3、PCR-DGGE技术分析结果:本研究通过对比2种DNA提取方法,提取到健康猕猴和肺炎链球菌感染后猕猴肠道菌群总DNA,利用细菌16S rRNA V3区通用引物进行扩增,产物经DGGE电泳,利用Quantity one图象分析软件对DGGE图谱进行分析;采用UPGAMA进行聚类分析;并计算Shannon-wiener多样性指数,Pielou指数,Margalef指数和Berger-Parker指数,数据采用SPSS19.0进行分析来测定群落结构形态。结果表明:试剂盒法提取的DNA纯度和数量上优于传统方法,DGGE图谱分析表明健康组猕猴肠道菌群结构相对稳定,PCR-DGGE条带数量以盲肠和结肠最多,其次是直肠、回肠和空肠,十二指肠最少,而肺炎链球菌感染组猕猴的各段肠道条带数显著减少(P<0.01),不同动物和肠段间菌群组成差别很大;健康组猕猴肠道细菌多样性指数、均匀度和丰度均高于感染组,与感染猕猴临床和病理表现相一致,感染后肠道微生物多样性降低。4、荧光定量PCR检测结果:采用SYBR Green I荧光定量PCR技术(FQ-PCR),建立6个菌属包括双歧杆菌、乳杆菌、拟杆菌、大肠杆菌、肠球菌和芽孢杆菌的实时荧光定量PCR检测方法,对健康组猕猴和感染组猕猴肠道内该6个菌属的数量和组成变化进行检测,结果表明:被检的6个菌属均为猕猴肠道中优势菌群,且其中双歧杆菌和乳杆菌含量最高(拷贝数对数分别为7.692±0.905,7.529±0.979),各个菌属在盲肠、结肠和直肠中含量高于肠道前段。肺炎链球菌感染后猕猴肠道优势菌群发生了较大变化,其中乳杆菌、双歧杆菌和拟杆菌拷贝数均显著下降(P<0.05);芽孢杆菌和肠球菌数量也有一定程度下降,而大肠杆菌拷贝数有所增加,但未达到显著性差异。表明肺炎链球菌感染后猕猴肠道菌群失衡,与感染诱发的肠道炎症反应之间易形成恶性循环,本研究结果也对肠道菌群结构与机体健康关系提供新的启示。5、免疫组化检测结果:(1)消化系统(食管、胃、空肠、盲肠以及肝组织)检测,结果显示IL-6、 IFN-γ以及CD3感染后水平升高,IL-2、sIgA则呈现下降趋势。各种因子的表达主要集中在黏膜层。IL-6和IFN-γ在感染组的表达面积显著高于健康组(p<0.01),其中在空肠、盲肠和胃组织的表达更明显。IL-2在感染组的表达面积显著低于健康组(p<0.01),但是光密度值显示感染组显著升高(p<0.01)。CD3和sIgA阳性细胞表达面积在两组之间的差异并不明显,sIgA仅在空肠有显著降低,而CD3也仅在空肠和肝脏有显著升高(p<0.05);CD3阳性细胞光密度值在肝脏和空肠明显增加,其他组织差异不明显。(2)呼吸系统(气管、肺)结果,感染组猕猴IFN-γ蛋白的阳性细胞面积在肺、气管和血管都明显增高(p<0.05),sIgA在感染组各组织的阳性表达也呈升高趋势,在气管的差异显著,IL-2蛋白的阳性表达面积略有增高,IL-6蛋白表达面积与健康组相比无明显差异;在气管,阳性细胞光密度值显示,和健康组比较,感染组IFN-γ、IL-2蛋白有明显增加(p<0.05),在血管和肺也仅有IgA和IFN-γ因子呈显著增加(p<0.05)。感染组猕猴肺脏和气管CD3蛋白表达产物的光密度值略高于健康组,但差异不明显,而其蛋白表达产物总面积则小于健康组,均达到了显著或极显著差异(P<0.05或P<0.01)。(3)免疫系统结果(脾和淋巴结),感染组猕猴脾脏内IFN-γ、IL-2蛋白的阳性表达面积都较健康组显著升高,而淋巴结的表达面积在两组间并无显著差异,除CD3外,各细胞因子和抗体都较健康组增加。感染组淋巴结内5种因子蛋白的表达光密度值均高于健康组,其中IL-6蛋白与健康组相比差异极显著(P<0.01), IFN-γ及IL-2蛋白表达量与健康组相比差异显著(P<0.05)。以上结果可看出,各种细胞因子和抗体的变化反应了肺炎链球菌对黏膜免疫系统的影响,这可能与肺炎链球菌的致病力相关联。整体上,与健康组比较,感染组IL-2在呼吸和免疫系统的表达面积增加而消化系统减少;IL-6表达面积在呼吸系统降低,免疫和消化系统增加;IFN-y在消化系统表达面积增加,而其他系统表达变化不一致;CD3在呼吸和免疫系统的表达面积减少,而消化系统整体增加;IgA的表达面积在呼吸和免疫系统的表达面积增加而消化系统减少。各个细胞因子相互联系,形成细胞因子网络,通过调节体液免疫和细胞免疫,相互协作抵御肺炎链球菌的侵害。
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全文目录
中文摘要 4-7 Abstract 7-16 第一部分 文献综述 16-54 1 肺炎链球菌研究进展 16-22 1.1 肺炎链球菌致病机理 16-17 1.2 肺炎链球菌性肺炎 17-22 1.2.1 肺炎链球菌性肺炎的发病过程 17-18 1.2.2 肺炎链球菌性肺炎免疫学 18-21 1.2.3 肺炎链球菌的防治 21-22 2 黏膜免疫系统研究进展 22-32 2.1 黏膜免疫系统简介 22-23 2.2 胃肠道黏膜免疫 23-28 2.2.1 胃肠道黏膜免疫系统的结构 23-24 2.2.2 胃肠道黏膜与细胞因子和抗体 24-25 2.2.3 肠道菌群和胃肠道黏膜免疫 25-27 2.2.4 胃肠道黏膜免疫功能以及疾病 27-28 2.3 呼吸道黏膜免疫系统 28-31 2.3.1 呼吸道黏膜结构 28-29 2.3.2 呼吸道黏膜免疫效应及相关疾病 29-31 2.4 黏膜免疫的应用进展 31-32 3 肠道菌群结构的分析技术研究进展 32-52 3.1 肠道菌群传统的培养和鉴定技术 32-33 3.2 肠道菌群镜检法 33 3.3 肠道菌群结构的现代分子解析方法 33-52 3.3.1 聚合酶链式反应技术(POLYMERASE CHAIN REACTION,PCR) 34-36 3.3.2 肠道菌群DNA指纹图谱技术 36-46 3.3.3 分子探针技术及基因芯片技术 46-49 3.3.4 实时荧光定量PCR(REAL-TIME FLUORESCENT QUANTITATIVE PCR,FQ-PCR) 49-52 4 结语 52-54 第二部分 实验正文 54-148 第一章 猕猴肺炎链球菌分离鉴定及感染后其消化、呼吸、免疫器官组织病理学观察 54-68 前言 54-55 1 材料与方法 55-58 1.1 菌种和质粒 55 1.2 主要仪器设备 55 1.3 试剂及配制 55-56 1.4 猕猴肺炎链球菌微生物学鉴定 56 1.4.1 猕猴肺炎链球菌的分离 56 1.4.2 革兰氏染色鉴定及胆汁溶菌实验 56 1.4.3 OPTOCHIN实验 56 1.4.4 小鼠毒力实验 56 1.5 肺炎链球菌16S rRNA序列的鉴定 56-58 1.5.1 引物设计 56-57 1.5.2 肺炎链球菌增菌培养 57 1.5.3 细菌基因组DNA提取 57 1.5.4 16Sr RNA基因目的片段的PCR扩增 57 1.5.5 琼脂糖凝胶电泳及PCR产物的回收 57-58 1.6 组织病理学观察 58 1.6.1 石蜡切片及染色 58 1.6.2 图像处理 58 2 结果 58-65 2.1 微生物形态学鉴定、胆汁溶菌实验和OPTOCHIN实验 58 2.2 小鼠毒力实验 58-59 2.3 16S rRNA PCR扩增及测序结果 59-62 2.4 消化系统组织病理学观察 62 2.5 呼吸系统组织病理学观察 62-64 2.6 免疫系统组织病理学观察 64-65 3 讨论 65-67 4 小结 67-68 第二章 PCR-DGGE技术对肺炎链球菌感染猕猴和健康猕猴消化道内菌群解析 68-81 前言 68-69 1 材料与方法 69-73 1.1 实验样品采集 69 1.2 主要试剂 69 1.3 主要仪器 69 1.4 主要溶液配制 69-70 1.5 肠内容物细菌总DNA的提取 70-71 1.6 DNA的定量和纯度检测 71 1.7 PCR扩增细菌16SrRNA变异区 71-72 1.8 DGGE分析 72-73 2 结果与分析 73-78 2.1 DNA提取方法的对比 73-74 2.2 16S rRNA V3区PCR-DGGE图谱指纹分析 74-76 2.3 DGGE图谱聚类分析 76-77 2.4 微生物群落多样性分析 77-78 3 讨论 78-80 3.1 DNA提取方法的分析 78 3.2 DGGE结果分析 78-80 4 小结 80-81 第三章 SYBR GREEN I实时荧光定量PCR对肺炎链球菌感染猕猴和健康猕猴消化道内特定菌群数量的解析 81-105 前言 81-82 1 材料与方法 82-90 1.1 样品采集及处理方法 82 1.2 标准菌株及其培养条件 82-83 1.3 主要实验仪器及试剂 83-84 1.4 实验试剂的配制 84 1.5 样品中菌群总DNA的提取 84 1.6 标准菌株基因组的提取 84-85 1.7 定量PCR引物设计 85-88 1.8 标准品制备所用引物 88-89 1.9 标准品的制备及鉴定 89-90 1.10 实时荧光定量PCR解析各样品中特定菌属菌群结构 90 2 结果 90-99 2.1 标准曲线的制备 90-94 2.2 实时荧光定量PCR(FQ-PCR)对猕猴消化道内菌群的定量检测 94-99 3 讨论 99-103 4 小结 103-105 第四章 感染肺炎链球菌猕猴呼吸系统内sIgA、IFN-γ、CD3、IL-2、IL-6蛋白的表达 105-116 前言 105-106 1 材料与方法 106-107 1.1 实验试剂与仪器设备 106 1.2 实验动物 106 1.3 取材 106-107 1.4 免疫组化SABC法检测 107 1.5 显微、拍照及图像分析 107 2 结果 107-113 3 讨论 113-115 4 小结 115-116 第五章 感染肺炎链球菌猕猴IL-6、IL-2、sIgA、IFN-γ以及CD3在消化系统的表达 116-138 前言 116-117 1 材料与方法 117-118 1.1 实验试剂与仪器设备 117 1.2 实验动物 117 1.3 取材 117 1.4 实验方法 117-118 1.5 显微、拍照及图像分析 118 2 结果 118-133 2.1 IL-6蛋白在消化系统中的表达 118-121 2.2 IL-2蛋白在消化系统的表达 121-124 2.3 IFN-Γ蛋白在消化系统的表达 124-126 2.4 SIgA蛋白在消化系统的表达 126-129 2.5 CD3蛋白在消化系统的表达 129-133 3 讨论 133-137 4 小结 137-138 第六章 感染肺炎链球菌猕猴免疫系统内sIgA、1FN-γ、CD3、IL-2、IL-6的表达 138-148 前言 138-139 1 材料与方法 139-140 1.1 实验试剂与仪器设备 139 1.2 实验动物 139 1.3 取材 139-140 1.4 免疫组化SABC法检测 140 1.5 显微、拍照及图像分析 140 2 结果 140-145 3 讨论 145-147 4 小结 147-148 第三部分 结论 148-149 参考文献 149-170 致谢 170-171 攻读学位期间发表的学术论文目录 171-172 缩写与全名 172
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中图分类: > 农业科学 > 畜牧、动物医学、狩猎、蚕、蜂 > 动物医学(兽医学) > 各种家畜、家禽、野生动物的疾 > 野生动物疾病
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