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名邛台地野生油茶种质资源遗传多样性的DNA分子标记研究

作 者: 考安都
导 师: 丁春邦
学 校: 四川农业大学
专 业: 植物学
关键词: ISSR SRAP RAPD 油茶 遗传多样性
分类号: S794.4
类 型: 硕士论文
年 份: 2013年
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内容摘要


油茶(Camellia oleifera)属于山茶科(Theaceae)山茶属(Camellia)常绿灌木或小乔木,是重要的木本油料树种。经油茶果压榨而成的茶油是一种对人体健康有益的保健型营养油,适合长期食用。我国的油茶种质资源主要分布在湖南、江西、广西、浙江、福建、四川等17个省(区),其中湖南、江西、广西的分布面积最大。而四川省境内的蒲江、邛崃、名山一带(名邛台地)丰富的野生油茶资源长期处于原始状态,没有得到合理的开发利用与保护。对油茶种质资源的遗传多样性研究,有利于开展油茶的良种选育与栽培。近年来分子标记在植物遗传多样性研究中得到了广泛的应用。本试验利用ISSRSRAP和(?)RAPD标记分析了名邛台地65份油茶种质材料的遗传多样性,并建立了聚类图谱,可以为油茶种质资源的良种选育与栽培提供一定理论依据。主要研究结果如下:1.优化了油茶ISSR、SRAP和RAPD分子标记的最佳反应体系:ISSR最佳反应体系为:2×PCR Mix12.5μL, DNA模板溶液1.25μL,引物1.25μL(10pmol/L), ddH2O补足至25μL,退火温度为52-58℃。RAPD最佳反应体系为:2×PCR Mix12.5μL, DNA模板溶液1μL,引物1μL(10pmol/L), ddH2O补足至25μL,退火温度为36.4~41℃。SRAP最佳反应体系为:2×PCR Mix12.5μL, DNA模板溶液1μL,引物1μL(10pmol/L), ddH2O补足至25μL,退火温度为50℃。2.从60条ISSR引物、143对SRAP和30条RAPD引物中筛选出多态性较高的16条ISSR引物、19对SRAP引物和8条RAPD引物进行油茶种质资源遗传多样性分析。其中ISSR引物扩增出213个位点,多态性位点203个,多态性百分率95.31%;SRAP引物扩增出281个位点,多态性位点238个,多态性百分率84.70%;RAPD引物扩增出105个位点,多态性位点94个,多态性百分率89.52%。3利用ISSR、SRAP和RAPD得到的相似系数范围分别为0.63~0.92、0.59~0.96、0.59~0.98,名邛台地野生油茶种质具有较丰富的遗传多样性,存在较大的遗传差异。从遗传学的角度来看,遗传多样性丰富,适应能力强,进化潜力大,有丰富的育种和遗传改良潜力。从聚类结果看,名邛台地野生油茶种质遗传变异与表型和地理分布没有明显的相关性。4.对ISSR、SRAP和RAPD分子标记进行分析,建立指纹图谱。应用NTSYS-pc (Version2.10e)分析了65份名邛台地野生油茶种质资源,结果表明,ISSR在遗传相似系数为0.651时可分为5个类群,SRAP遗传相似系数为0.640时可分为6个类群,RAPD在遗传相似系数为0.708时也可分为5个类群。5.对ISSR、SRAP和RAPD以及三者的综合数据形成的4个遗传相似矩阵进行相关性研究,得到4个矩阵之间均呈极显著相关。将ISSR、SRAP和RAPD标记统计数据合并后的遗传相似系数在0.62-0.94,遗传相似系数为0.660时可分为5个类群,一致性检验表明,ISSR分子标记的聚类结果与合并后的聚类结果更为相近。

全文目录


摘要  4-6
Abstract  6-10
1 文献综述  10-24
  1.1 油茶的植物研究  10-15
    1.1.1 油茶的形态特征  10-11
    1.1.2 油茶的生长习性  11-12
    1.1.3 油茶的地理分布  12-13
    1.1.4 油茶产业发展概况  13-15
  1.2 遗传多样性研究概况  15-19
    1.2.1 遗传多样性的概念  15
    1.2.2 遗传多样性检测方法  15-19
  1.3 油茶的研究进展  19-24
    1.3.1 表型性状研究进展  19-20
    1.3.2 分子生物学研究进展  20-21
    1.3.3 育种与栽培技术的研究  21-22
    1.3.4 油茶精深加工技术的研究  22-23
    1.3.5 其他方面的研究  23-24
2 立题依据  24-25
3 材料与方法  25-33
  3.1 材料  25-28
    3.1.1 植物材料  25
    3.1.2 主要试剂  25-27
    3.1.3 主要仪器  27-28
  3.2 试验方法  28-33
    3.2.1 取样  28
    3.2.2 DNA提取、纯化和定量  28-30
    3.2.3 ISSR分析  30-31
    3.2.4 SRAP分析  31
    3.2.5 RAPD分析  31-32
    3.2.6 数据统计与分析  32-33
4 结果与分析  33-50
  4.1 基因组DNA的提取及质量检测  33-34
  4.2 ISSR遗传多样性分析  34-40
    4.2.1 ISSR引物筛选  34
    4.2.2 退火温度的选择  34-35
    4.2.3 ISSR扩增结果  35-38
    4.2.4 ISSR分子标记遗传聚类  38-40
  4.3 SRAP遗传多样性分析  40-43
    4.3.1 SRAP引物筛选  40
    4.3.2 SRAP扩增结果  40-42
    4.3.3 SRAP分子标记遗传聚类  42-43
  4.4 SRAP遗传多样性分析  43-49
    4.4.1 退火温度的选择  43-44
    4.4.2 RAPD引物筛选  44
    4.4.3 RAPD扩增结果  44-48
    4.4.4 RAPD分子标记遗传聚类  48-49
  4.5 遗传多样性的综合分析  49-50
5 讨论  50-53
  5.1 基因组DNA的提取  50
  5.2 PCR扩增体系  50-51
  5.3 PCR反应的稳定性及影响因素  51
  5.4 名邛台地野生油茶种质资源的遗传多样性  51-53
6 结论  53-54
参考文献  54-59
致谢  59-60
附录  60-70
在攻读学位期间的学术论文成果  70

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中图分类: > 农业科学 > 林业 > 森林树种 > 特用阔叶树类 > 油茶
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