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黄果柑的亲本及黄果柑与不知火的亲缘关系探究
作 者: 王雪飞
导 师: 汪志辉
学 校: 四川农业大学
专 业: 果树学
关键词: 黄果柑 不知火 SSR cpSSR PAGE
分类号: S666.9
类 型: 硕士论文
年 份: 2013年
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内容摘要
黄果柑是在四川省雅安市石棉县发现的一个天然柑橘杂种。本研究采集了石棉县现有的栽培或生长历史较久远的柑橘为材料,对其进行了形态学分析、SSR分子标记和cpSSR分子标记,以探明黄果柑的遗传背景,找到黄果柑的可能亲本,并利用SSR分子标记在分子水平上探究黄果柑与不知火之间的亲缘关系,为黄果柑的进一步开发、利用提供理论依据。研究结果如下:(1)形态学数值性状分析结果表明黄果柑在叶柄长度、果形指数、叶形指数与先锋橙极其相近,而与药柑、红橘、脐橙、沙田柚、兴津温州蜜柑的差异较大。而非数值性状编码后聚类分析结果表明,8份柑橘材料主要分成两大类,沙田柚作为一大类,其他7份材料作为另一大类。黄果柑与先锋橙聚类在一起。在形态学基础上,黄果柑与先锋橙可能具有较近的亲缘关系。(2)在SSR标记中,使用17对引物进行标记,其中有12对引物显示良好的多态性,能够有效区分8份柑橘材料。通过聚类分析知,8份柑橘材料主要分成两大类,沙田柚作为一大类,其他7份材料作为另一大类。先锋橙和脐橙聚类在一起,先锋橙与黄果柑的遗传相似系数约80%,脐橙与黄果柑的遗传相似系数约75%;红橘、药柑、兴津温州蜜柑聚类在一起,红橘与黄果柑的遗传相似系数约77%,药柑、兴津温州蜜柑与黄果柑的遗传相似系数约60%。黄果柑与先锋橙亲缘关系最近;与红橘其次;与脐橙、兴津温州蜜柑和药柑再次;而与沙田柚亲缘关系最远。(3)在cpSSR标记中,总共使用4对引物进行标记,其中引物SPCC1和SPCC3显示良好的多态性,能够有效区分8份柑橘材料。两个引物的电泳图均显示,黄果柑与先锋橙带型一致,而柑橘中的叶绿体DNA(cpDNA)是母性遗传的,黄果柑的母本可能来自先锋橙。综合形态标记和分子标记的分析结果,黄果柑可能是以甜橙为母本,以橘类为父本的杂交种。(4)黄果柑与不知火亲缘关系探究研究中,同样使用17对引物进行SSR标记,结果也有12对引物能够将黄果柑与不知火区分开来。SSR变异几率较小,黄果柑与不知火亲缘关系可能较远。
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全文目录
摘要 3-5 Abstract 5-10 前言 10-11 1 文献综述 11-18 1.1 黄果柑的研究 11 1.2 遗传标记 11-12 1.3 SSR发现过程、原理、结构特点及优缺点 12-14 1.3.1 SSR发现过程 12 1.3.2 SSR原理 12 1.3.3 SSR结构特点 12-13 1.3.4 SSR优缺点 13-14 1.4 SSR分子标记过程 14-15 1.5 SSR分子标记在柑橘上的研究 15-18 1.5.1 柑橘品种鉴定 15-16 1.5.2 柑橘亲缘关系研究 16-17 1.5.3 柑橘遗传多样性研究 17-18 1.5.4 指纹图谱和遗传图谱的构建 18 2 研究目的与意义 18-19 3 材料与方法 19-27 3.1 试验材料 19-20 3.2 技术路线 20 3.2.1 黄果柑亲本鉴定技术路线 20 3.2.2 黄果柑与不知火的亲缘关系探究技术路线 20 3.3 实验试剂与主要仪器 20-21 3.3.1 实验试剂 20-21 3.3.2 实验仪器 21 3.4 形态调查和生理指标测定 21 3.5 DNA提取及检测 21-22 3.6 SSR分子标记 22-23 3.7 cpSSR分子标记 23-24 3.8 PAGE电泳及银染 24-25 3.8.1 准备 24 3.8.2 配制聚丙烯酰胺凝胶 24-25 3.8.3 银染 25 3.9 数据处理 25-27 4 结果与分析 27-34 4.1 黄果柑的形态特征及生物学习性 27 4.2 DNA质量检测 27-28 4.2.1 核酸蛋白仪检测 27-28 4.2.2 琼脂糖电泳检测 28 4.3 黄果柑亲本鉴定 28-33 4.3.1 形态鉴定 28-30 4.3.2 SSR分子鉴定 30-32 4.3.3 cpSSR分子鉴定 32-33 4.4 黄果柑与不知火的亲缘关系探究 33-34 5 讨论与小结 34-35 5.1 讨论 34-35 5.2 小结 35 6 展望 35-36 参考文献 36-42 致谢 42-43 攻读硕士学位期间发表论文 43
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中图分类: > 农业科学 > 园艺 > 果树园艺 > 柑桔类 > 其他
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