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鸡HMGCR基因多态性及其与经济性状相关性研究

作　者: 魏杨
导　师: 王清义; 康相涛
学　校: 河南农业大学
专　业: 动物营养与饲料科学
关键词: 固始鸡-安卡鸡资源群 F2代群体 丝毛乌骨鸡 3-羟基-3-甲基戊二酸单酰辅酶A还原酶基因(HMGCR) 单核苷酸多态性(SNPs) 关联分析
分类号: S831
类　型: 硕士论文
年　份: 2012年
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内容摘要


3-羟基-3-甲基戊二酸单酰辅酶A还原酶（HMGCR）是胆固醇生物合成过程中的限速酶，并且在内源胆固醇生物合成途径中扮演着重要的角色。本研究中，我们以HMGCR基因为候选基因，使用DNA池测序技术、PCR扩增技术、PCR-RFLP技术和CRS-PCR-RFLP技术在固始鸡-安卡鸡F2代资源群及丝毛乌骨鸡中检测遗传变异情况，并分析了该基因的突变位点与固始鸡-安卡鸡F2代资源群主要经济性状和丝毛乌骨鸡蛋品质及鸡蛋胆固醇含量之间的关联性。主要结果如下：1、在固始鸡-安卡鸡F2代资源群中，在鸡3-羟基-3-甲基戊二酸单酰辅酶A还原酶基因上检测到51个SNPs，具体分析了其中的3个。其中A5816T位点位于内含子8内；G12217T位点处于外显子17上，导致了谷氨酸→组氨酸的错义突变；T12684C位点位于外显子18上，其引起了脯氨酸的同义突变。通过PCR-RFLP或CRS-PCR-RFLP法，对A5816T、G12217T和T12684C进行分析。群体遗传学表明：A5816T、G12217T和T12684C突变位点多态信息含量均为中度多态位点；这三个位点的杂合度分别为0.4915、0.4546、0.4774。2、对3个酶切位点多态性与固始鸡-安卡鸡资源群F2代群体主要经济性状关联分析表明，HMGCR基因A5816T位点两种基因型与出生重、12周龄体重、12周龄胸骨长、8周龄胸深、腿肌剪切力、胸肌剪切力、腿肌纤维直径、碱性磷酸酶、低密度脂蛋白和乳酸脱氢酶显著相关（P<0.1）；G12217T位点对屠体重、半净膛重、全净膛重、头重、爪重、心脏重、脾脏重、腿重、腿肌重、爪率、双翅率、2,4,6,8,10,12周龄体重、12周龄胫长、12周龄胫围，8,12周龄盆骨宽、4,8,12周龄体斜长、4,8,12周龄胸骨长、腿肌纤维密度、腿肌纤维直径、胸肌纤维圆度、胸肌纤维直径、碱性磷酸酶、乳酸脱氢酶、总蛋白和低密度脂蛋白具有显著影响（P<0.1）；T12684C位点不同基因型对半净膛重、心脏重、腿肌重、胰腺率、2,4,6,8,12周龄体重、8周龄胫长、4,8,12周龄胫围、4,12周龄体斜长、12周龄胸骨长、腹脂率、腿肌纤维密度、谷草转氨酶、总蛋白、白蛋白、球蛋白、胆碱酯酶、甘油三酯、乳酸脱氢酶具有显著影响（P<0.1）。3、在丝毛乌骨鸡中验证鸡3-羟基-3-甲基戊二酸单酰辅酶A还原酶基因G12217T和T12684C两个突变位点，群体遗传学表明：G12217T和T12684C突变位点多态信息含量均为中度多态位点；这三个位点的杂合度分别为0.499、0.504。4、对2个突变位点多态性与丝毛乌骨鸡蛋品质及鸡蛋胆固醇含量的关联性进行分析表明，G12217T突变位点仅对鸡蛋中胆固醇含量具有显著的影响（P<0.1）；T12684C突变位点三种基因型与蛋黄重显著相关（P<0.1）。

全文目录


致谢  4-8
摘要  8-9
1 文献综述  9-20
  1.1 胆固醇简介  9-12
    1.1.1 胆固醇的来源  9-10
    1.1.2 胆固醇的转化  10-11
    1.1.3 胆固醇在产蛋鸡体内的代谢  11-12
  1.2 3-羟基-3-甲基戊二酸单酰辅酶 A 还原酶  12-13
    1.2.1 3-羟基-3-甲基-戊二酸单酰辅酶 A 还原酶(HMGCR)的功能  12
    1.2.2 胆固醇对 HMG-CoA 还原酶的调节  12
    1.2.3 胆汁酸对 HMG-CoA 还原酶的调节  12
    1.2.4 甲状腺素对 HMG-CoA 还原酶的调节  12-13
    1.2.5 空腹对 HMG-CoA 还原酶的调节  13
    1.2.6 HMG-CoA 还原酶的昼夜节律  13
  1.3 HMG-CoA 还原酶基因  13-14
    1.3.1 HMG-CoA 还原酶基因的结构  13
    1.3.2 HMGCR 基因多态性  13-14
    1.3.3 HMGCR 基因的组织表达特异性  14
  1.4 单核苷酸多态性(SNPs)  14-20
    1.4.1 SNPs 简介  14-15
    1.4.2 SNPs 的特点  15
    1.4.3 SNPs 的检测方法  15-20
2 固始鸡-安卡鸡 F2代资源群 HMGCR 基因遗传变异的研究  20-51
  2.1 试验材料  20-22
    2.1.1 试验动物  20-21
    2.1.2 血样的采集与处理  21
    2.1.3 主要试剂及设备  21-22
  2.2 试验方法  22-27
    2.2.1 基因组 DNA 的提取  22
    2.2.2 DNA 检测  22-23
    2.2.3 DNA 混池的构建  23
    2.2.4 引物的设计与合成  23-25
    2.2.5 引物的稀释  25
    2.2.6 最佳 PCR 条件的建立  25-26
    2.2.7 PCR 产物检测  26
    2.2.8 PCR-RFLP  26
    2.2.9 测序验证  26
    2.2.10 统计分析  26-27
  2.3 结果与分析  27-47
    2.3.1 鸡 HMGCR 基因遗传变异的检测  27-31
    2.3.2 HMGCR 基因各突变位点与资源群经济性状关联分析结果  31-47
  2.4 讨论  47-50
    2.4.1 SNPs 检测技术的讨论  47
    2.4.2 HMGCR 基因遗传分布与变异  47-48
    2.4.3 鸡 HMGCR 基因多态位点与鸡经济性状关联分析  48-50
  2.5 小结  50-51
3 丝羽乌骨鸡 HMGCR 基因多态性与鸡蛋胆固醇的关联性研究  51-63
  3.1 试验材料与方法  51-53
    3.1.1 试验材料  51
    3.1.2 主要试剂及设备  51-52
    3.1.3 试验方法  52-53
    3.1.4 数据分析  53
  3.2 结果与分析  53-60
    3.2.1 丝毛乌骨鸡蛋品质及鸡蛋胆固醇测定结果  53-54
    3.2.2 鸡 HMGCR 基因遗传变异的检测  54-57
    3.2.3 HMGCR 基因各突变位点与丝毛乌骨鸡蛋品质关联分析结果  57-60
  3.3 讨论  60-62
    3.3.1 HMGCR 基因两个多态位点与蛋品质相关性分析  60-61
    3.3.2 HMGCR 基因两个多态位点与鸡蛋胆固醇含量相关性分析  61-62
  3.4 小结  62-63
参考文献  63-70
Abstract  70-71

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中图分类: > 农业科学 > 畜牧、动物医学、狩猎、蚕、蜂 > 家禽 > 鸡
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