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2010年宁夏致病疫霉群体特征的研究
作 者: 宋俊丽
导 师: 朱杰华; 杨志辉
学 校: 河北农业大学
专 业: 植物病理学
关键词: 致病疫霉 交配型 甲霜灵抗性 线粒体单倍型 简单序列重复 扩增片段长度多态性
分类号: S435.32
类 型: 硕士论文
年 份: 2012年
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内容摘要
马铃薯晚疫病是由致病疫霉Phytophthora infestans (Mont.) de Bary引起的,是马铃薯生产上最具毁灭性的病害之一,给马铃薯生产造成了巨大损失。本研究对2010年采集自宁夏的94个马铃薯晚疫病菌株进行了交配型和甲霜灵抗性的表型测定,并利用聚合酶链式反应—限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)、简单序列重复(SSR)和扩增片段长度多态性(AFLP)等分子标记技术对该群体的基因型进行了分析。由于在实验过程中发现了大量的A2交配型菌株,又选取了黑龙江、吉林和河北等地8省以及瑞士、美国和荷兰共计82株致病疫霉菌株,其中A1交配型40株,A2交配型42株,测定了该群体对甲霜灵的敏感性,并分析了该群体的线粒体基因型、SSR基因型及AFLP基因型。主要研究结果如下:1.宁夏致病疫霉群体特征:1.1交配型的测定:对2010年采自宁夏的94株致病疫霉进行了交配型的测定,结果表明,A2交配型86株,A1交配型1株,自育型7株。1.2甲霜灵敏感性测定:测定了94株宁夏致病疫霉菌株对甲霜灵的敏感性,结果供试菌株全部为抗性菌株,其中高抗菌株89株,中抗菌株5株。1.3线粒体DNA单倍型测定:以来自其它地域的8株致病疫霉菌株作参考,利用聚合酶链式反应—限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)对94株宁夏致病疫霉菌株的线粒体DNA单倍型进行了分析,发现所有被测菌株均为Ia型。1.4 SSR基因型分析:以来自其它地域的8株致病疫霉菌株作参考,利用6对SSR引物对94株宁夏致病疫霉菌株进行了基因型鉴定,共鉴定出了2种SSR基因型,I型93株,是优势基因型,聚类结果显示群体的遗传多样性并不高,遗传差异比较小。1.5 AFLP基因型分析:利用4对多态性高、稳定性好的选择性扩增引物组合,对供试50个致病疫霉菌株(其中包括8个参考菌株)进行了AFLP扩增,共扩增出201条谱带,其中多态性条带173条,多态性百分率为86.1%。遗传多样性分析表明供试致病疫霉群体遗传多样性水平并不高,聚类结果显示A2交配型菌株与自育型菌株亲缘关系比较近,宁夏致病疫霉群体存在遗传分化。2.致病疫霉A1、A2交配型群体特征:2.1甲霜灵敏感性测定:测定了采集自黑龙江、吉林、河北和内蒙古等地的82个致病疫霉不同交配型菌株对甲霜灵的敏感性,结果A1交配型抗性比率为55%,A2交配型抗性比率为97%。2.2线粒体DNA单倍型测定:利用聚合酶链式反应—限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)对82个致病疫霉菌株的线粒体DNA单倍型进行了分析,发现A1交配型菌株为Ⅱa和Ⅱb型,A2交配型菌株均为Ia型。2.3 SSR基因型分析:利用6对SSR引物对黑龙江、吉林、河北和内蒙古等地82个致病疫霉菌株进行了基因型鉴定,共鉴定出了17种SSR基因型。A1交配型菌株鉴定出12种SSR基因型,ⅩⅡ型是优势基因型;A2交配型菌株鉴定出5种SSR基因型,Ⅲ型是优势基因型。2.4 AFLP基因型分析:利用4对选择性扩增引物组合,对供试82个致病疫霉菌株进行了AFLP扩增,共扩增出212条谱带,其中多态性条带190条,多态性百分率为89.6%。遗传多样性分析表明供试致病疫霉群体遗传多样性水平并不高,聚类结果显示整体上A1交配型菌株与A2交配型菌株聚在不同的分支上,AFLP基因型与病菌的交配型有一定的相关性,与地理来源没有明显相关性。
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全文目录
摘要 4-6 Abstract 6-10 1 引言 10-16 1.1 致病疫霉交配型的研究 10-11 1.2 致病疫霉甲霜灵抗性的研究 11-12 1.3 致病疫霉线粒体基因型的研究 12-13 1.4 致病疫霉 SSR 分子标记的研究 13-14 1.5 致病疫霉 AFLP 分子标记的研究 14-15 1.6 本研究的目的及意义 15-16 2 材料与方法 16-28 2.1 试验材料及使用仪器 16-22 2.1.1 供试菌株 16-19 2.1.2 供试培养基 19-20 2.1.3 供试主要试剂 20 2.1.4 供试主要仪器 20 2.1.5 mtDNA 单倍型测定 PCR 扩增引物和限制性内切酶 20-21 2.1.6 SSR 引物 21 2.1.7 AFLP 接头、引物的编号及序列 21-22 2.2 试验方法 22-28 2.2.1 致病疫霉的分离及纯化 22 2.2.2 致病疫霉交配型的测定 22 2.2.3 致病疫霉对甲霜灵的敏感性测定 22 2.2.4 致病疫霉线粒体基因型分析 22-24 2.2.5 致病疫霉 SSR 基因型分析 24-25 2.2.6 致病疫霉AFLP 基因型分析 25-28 3 结果与分析 28-42 3.1 宁夏致病疫霉群体特征的研究 28-37 3.1.1 宁夏致病疫霉交配型分析 28 3.1.2 宁夏致病疫霉对甲霜灵敏感性分析 28 3.1.3 宁夏致病疫霉群体线粒体DNA 单倍型分析 28-29 3.1.4 宁夏致病疫霉群体 SSR 基因型分析 29-32 3.1.5 宁夏致病疫霉群体 AFLP 基因型分析 32-37 3.2 致病疫霉A1、A2 交配型群体特征的研究 37-42 3.2.1 致病疫霉A1、A2 交配型群体对甲霜灵抗性的比较 37-38 3.2.2 致病疫霉A1、A2 交配型群体线粒体DNA 单倍型的分析 38 3.2.3 致病疫霉A1、A2 交配型群体SSR 基因型的分析 38-40 3.2.4 致病疫霉A1、A2 交配型群体AFLP 基因型的分析 40-42 4 讨论 42-44 4.1 2010 年宁夏致病疫霉群体特征的研究 42-43 4.2 致病疫霉A1、A2 交配型群体特征的研究 43-44 5 结论 44-45 参考文献 45-53 附录 53-57 在读期间发表的学术论文 57-58 作者简历 58-59 致谢 59-60
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中图分类: > 农业科学 > 植物保护 > 病虫害及其防治 > 农作物病虫害及其防治 > 薯类作物病虫害 > 马铃薯(土豆)病虫害
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