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人类新基因识别与蛋白质结构域鉴定

作 者: 郭金虎
导 师: 余龙
学 校: 复旦大学
专 业: 遗传学
关键词: 基因克隆 ESTs策略 RAB41 LPAAT-ζ ASB-17 睾丸  基因表达 蛋白序列基序 甘油酸激酶 MANSC MPPN
分类号: Q987
类 型: 博士论文
年 份: 2004年
下 载: 357次
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内容摘要


本论文分为三部分,第一部分是154个人类新基因的识别及初步的实验分析;第二部分是关于人17种组织基因表达谱分析的相关生物信息学研究;第三部分为新的蛋白质结构域的鉴定与功能分析。 在第一部分工作中,作者采用ESTs策略,通过多种方法,包括作者自己提出的一些新方法预测了154个人类新基因,并有约1/3己通过在多种组织的cDNA文库里进行PCR扩增和测序得到证实,其余基因的实验验证还在进行之中。这些基因包含了许多种类,本文按照GO分类法和Panther分类法对其进行了归类。这些基因可作为进一步研究和开发的重要资源。作者以其中的RAB41、ASB-17、LPAAT-汲甘油酸激酶GLYTK-1和GLYCTK2等基因为例探讨了几种克隆基因的方法,并对这些基因功能进行了初步的探讨。 第二部分采用数字差异显示的方法对760个Unigene在人类17种组织中的表达数据进行分析,结果显示人的大睾丸的基因表达谱最为相似。这一结果可能提示了睾丸与大脑在人的物种形成和进化过程中都起着重要作用。 第三部分介绍了两个新的蛋白质结构域(MANSC和MPPN)的鉴定工作。MANSC是一个出现于多细胞动物膜蛋白或细胞外蛋白中的domain,包括低密度脂蛋白-11(LRP-11)、肝细生长因子激活物抑制蛋白抑制因子HAI-1(Hepatocyte growth factor activator inhibitor 1)及许多未知的膜蛋白或细胞外蛋白。推测在HAI-1中,MANSC的功能可能是通过与肝细胞生长因子激活物(HGFA)或其类似物matriptase的结合而发挥功能。MPPN结构域与已知的RNA识别和结合结构域rrm具有密切关联,可能也起着RNA结合的作用,在细胞周期中可能发挥重要作用。

全文目录


扉页  2-4
复旦大学研究生创新基金资助声明  4-5
名词缩写  5-6
中文摘要及关键词  6-7
英文摘要及关键词  7-8
目录  8-9
第一部分 人类新基因识别及初步的功能分析  9-45
  1 前言  9
  2 材料和方法  9-22
  3 结果和讨论  22-45
第二部分 人睾丸组织表达谱相似性的分析  45-58
  1 前言  45-46
  2 材料和方法  46-47
  3 结果和讨论  47-58
第三部分 蛋白质结构域的鉴定与功能分析  58-75
  1 前言  58-59
  2 材料和方法  59-61
  3 结果和讨论  61-75
小结  75-76
文献综述  76-96
  1 采用ESTs策略电子克隆新基因的研究方法与进展  76-87
  2 蛋白质结构域的鉴定  87-96
附录  96-125
  致谢  96-98
  发表论文列表、参编著作、申请专利、申请和主持课题及获奖情况  98-100
  以第一作者发表的论文单印本复印件  100-125

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中图分类: > 生物科学 > 人类学 > 人类遗传学
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