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基于MEMS技术的PCR芯片的研究
作 者: 赵湛
导 师: 崔大付
学 校: 中国科学院研究生院(电子学研究所)
专 业: 物理电子学
关键词: MEMS技术 PCR生物芯片 单片集成
分类号: TN492
类 型: 博士论文
年 份: 2003年
下 载: 439次
引 用: 2次
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内容摘要
PCR芯片是对微量DNA进行扩增放大的一种生化反应芯片,在整个生物芯片的研究和发展中起着重要的作用。综合国内外在PCR芯片研究方面取得的成果,采用基于MEMS技术的研究方法,在硅基片上实现了集成的PCR芯片。芯片上集成了DNA反应室,微通道、温度传感器以及加热体等功能和部件,大小为8mm×4mm×0.3mm。利用深刻蚀技术制作出一个4mm×2mm×0.3mm容积约为2微升的反应室,反应室的底为约2微米厚的氮化硅(Si3N4)膜。铂加热子和温度传感器是在Si3N4膜上沉积和制作出图形形成的。这样的PCR芯片可以使系统微型化,可以很方便地应用在医疗诊断、野外生化分析等领域。配合PCR芯片研制了微型热循环控制系统,包括硬件和软件两大部分。硬件的设计主要从减少尺度,降低功耗等方面考虑,以实现和PCR芯片相适应的仪器微型化,从而达到便携、快捷地实现DNA—PCR的反应。软件部分从温度控制精度、以硬件简捷、操作以人为本的原则进行编制。研究设计了不同PCR芯片的结构和加热子等的热传导、温度场分布等物理特性。从理论上证明设计的可行性。进行了PCR芯片的实验前的表面处理方法的实验,选用乙肝病毒的试剂盒,进行了芯片上的DNA扩增实验。DNA利用SYBR@GreenⅠ荧光染料进行标记,扩增的产物在荧光显微镜下用Cool CCD记录,取得了满意的结果。PCR芯片的物理特性如下:1.反应池容积:<2μl;2.升温速率:可达15℃/s;3.降温速率:可达10℃/s;4.控温精度:≤0.4℃;5.功耗:<800mW。
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全文目录
摘要 7-8 ABSTRACT 8-9 第1章 前言 9-26 1.1 生物芯片技术的发展 9-15 1.1.1 什么是生物芯片 9-10 1.1.2 点阵型生物芯片 10-12 1.1.3 实验室芯片 12-15 1.1.4 生物芯片的应用 15 1.2 PCR技术的发展 15-20 1.2.1 什么是PCR 15-16 1.2.2 PCR-DNA扩增原理 16-17 1.2.3 PCR技术发展的历史 17-18 1.2.4 PCR扩增的特点 18-19 1.2.5 PCR扩增的检测技术 19-20 1.3 MEMS技术的发展 20-24 1.3.1 什么是MEMS 20-21 1.3.2 MEMS技术的特点 21-22 1.3.3 MEMS的现状与发展趋势 22-23 1.3.4 BioMEMS 23-24 1.4 本论文结构和内容简介 24-26 第2章 PCR芯片的研究现状 26-47 2.1 传统PCR实现技术 26-27 2.1.1 固定温度式控制技术 27 2.1.2 可变温度控制技术 27 2.2 PCR芯片的技术研究 27-33 2.2.1 微井型芯片 28-29 2.2.2 连续流动型芯片 29 2.2.3 旋转型芯片 29-31 2.2.4 点阵型芯片 31-32 2.2.5 集成型芯片 32-33 2.3 PCR芯片加热和冷却技术 33-36 2.3.1 Peltier效应器件技术 33-35 2.3.2 红外光源技术 35-36 2.3.3 集成加热子技术 36 2.4 PCR芯片扩增检测技术 36-40 2.4.1 毛细管电泳检测 36-37 2.4.2 荧光标记检测技术 37-39 2.4.3 集成芯片检测技术 39-40 2.5 其他PCR芯片研究 40-46 2.5.1 清华大学程京研究组的PCR芯片 40 2.5.2 新加坡IME科学家研制的PCR芯片 40-41 2.5.3 加州大学Eric T.Lagally研究的PCR-CE芯片 41-42 2.5.4 橡树里国家实验室L.C.Waters等的PCR-CE芯片 42-43 2.5.5 加州大学A.T.Woolley等研究的PCR集成器件 43-44 2.5.6 斯坦福大学A.M.Chaudhari等PCR反应室阵列 44-45 2.5.7 密歇根大学Huinan Yu研究的塑料PCR芯片 45-46 2.6 小结 46-47 第3章 基于MEMS技术的PCR芯片的工艺实现 47-62 3.1 PCR芯片的结构设计 47-50 3.1.1 PCR芯片的材料的选择 47-48 3.1.2 加热子与测温传感器的材料选择 48-49 3.1.3 PCR反应室结构 49-50 3.2 工艺流程 50-58 3.2.1 MEMS器件的平面加工技术 50-53 3.2.2 MEMS器件的体加工技术 53-55 3.2.3 PCR芯片的工艺流程 55-58 3.3 PCR芯片的封装 58-60 3.3.1 芯片级封装 58-59 3.3.2 二次封装 59-60 3.4 小结 60-62 第4章 PCR芯片的微控制系统的研制 62-73 4.1 PIC微控制器简介 62-63 4.2 PCR芯片热循环微控制系统的硬件设计 63-71 4.2.1 电源电路设计 64-65 4.2.2 传感器电路设计 65-68 4.2.3 加热功率电路设计 68 4.2.4 LCD显示 68-69 4.2.5 CPU系统电路 69-71 4.3 PCR芯片微控制系统的软件设计 71-72 4.4 小结 72-73 第5章 PCR芯片的物理特性研究 73-85 5.1 MEMS器件的传热 73-75 5.1.1 传热理论 73-75 5.1.2 温度场 75 5.2 PCR芯片的热场分布 75-79 5.3 PCR芯片的电气特性 79-84 5.3.1 温度校准 80-82 5.3.2 功率特性 82-84 5.4 小结 84-85 第6章 DNA在芯片上的扩增试验研究 85-91 6.1 芯片的表面修饰 85-87 6.1.1 DNA在硅片上的吸附 85 6.1.2 PCR芯片的表面修饰 85-87 6.2 DNA扩增试验 87-90 6.2.1 DNA反应样品的密封 87-88 6.2.2 反应体系 88-89 6.2.3 扩增结果 89-90 6.3 小结 90-91 第7章 结论 91-96 7.1 PCR芯片研究的特点 91-92 7.2 PCR芯片研究的创新点 92-94 7.3 PCR芯片研究的进一步工作 94-96 参考文献 96-101 致谢 101-102 附录 102-103 A. 发表文章: 102-103 B. 申请发明专利: 103
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中图分类: > 工业技术 > 无线电电子学、电信技术 > 微电子学、集成电路(IC) > 专用集成电路
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