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三维医学图像精准分割算法研究

作　者: 石峰
导　师: 杨杰
学　校: 上海交通大学
专　业: 模式识别与智能系统
关键词: 医学图像分割图像增强双边滤波形变模型活动线图分割图形处理器元胞自动机核磁共振计算机断层成像嵌入边缘置信度
分类号: TP391.41
类　型: 博士论文
年　份: 2009年
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内容摘要

随着计算机技术的发展和医学影像技术的提高,医学图像不仅可以将患者的身体结构投影到二维平面上来观察,而且能重建出体内的三维空间模型,且成像的分辨率越来越高。医学图像分割,作为一种把图像中感兴趣的区域标注出来的方法,是许多基于医学图像的诊断、治疗和分析应用的重要基础步骤。传统的医学图像分割算法大多基于二维图像来研究,应用到三维数据中也是直接对三维数据中的每一个切片来进行二维分割,然后组合成三维目标模型。这种方法的缺点就是没有考虑到图像中与切片垂直方向上的图像信息。然而,直接在三维空间中进行分割所面临的难点主要在于:(1)受一些分割模型的限制,无法将二维平面上的曲线扩展到三维空间中的曲面,如图论中的最短路径问题2)时间效率低以至于不实用。(3)受显示技术的限制,交互方式不直观。本文在回顾与分析众多医学图像分割方法的基础上,基于上述出发点,研究了一系列基于三维体数据的分割方法。其中包括自动的分割方法和交互式的分割方法。具体来讲,本文的主要工作和创新点如下:1.一个好的滤波器对分割结果有着重要的影响,因此,本文首先给出了基于自适应加权中值的双边滤波方法。此方法综合了中值滤波和双边滤波的特点,对冲击噪声和高斯噪声同时具有抑制作用。2.提出了自动从头部MRI T1数据中分割大脑组织的方法。该方法首先用图分割方法来对数据进行粗分割,然后基于marching cubes方法提取此粗分割结果的表面网格,把此网格作为初始表面,利用参数曲面演化方法来对整个大脑进行分割。3.提出基于嵌入边缘置信度的活动线交互分割方法。此方法考虑了医学图像中感兴趣组织边缘较弱的特征,克服了传统活动线方法需要较多控制点才能把活动线限制在目标边缘上的弱点。实验证明,在达到同样分割精度条件下,本方法使用更少的控制点,这意味着操作者工作效率的提高。4.提出基于非线性核函数的元胞自动机交互分割方法。该方法有效减少了边缘区域元胞状态的频繁切换,从而加快了算法的收敛速度。5.深入研究了GPU的体系结构和用于通用计算的方法。提出了基于GPU实现的三维元胞自动机交互分割方法。实验结果显示,该方法GPU实现的运行效率是CPU版本的90倍左右。本文最后对全文进行了总结,并对未来的工作进行了展望。

全文目录

摘要  5-7
ABSTRACT  7-12
第一章绪论  12-29
  1.1 引言  12
  1.2 研究背景及意义  12-15
  1.3 相关技术和国内外研究现状  15-24
    1.3.1 基于图像结构的分割方法  15-18
    1.3.2 基于统计的分割方法  18-21
    1.3.3 混合方法  21-24
  1.4 医学图像分割算法的性能评价体系  24-26
    1.4.1 分割结果的正确性  24-26
    1.4.2 分割算法的效率  26
  1.5 本文的主要创新点和内容安排  26-29
第二章医学图像分割预处理  29-41
  2.1 分割预处理常用算法  29-33
    2.1.1 中值滤波  29-30
    2.1.2 高斯滤波  30
    2.1.3 各向异性扩散滤波  30-31
    2.1.4 双边滤波  31-33
  2.2 冲击噪声自适应双边滤波算法  33-36
    2.2.1 自适应中心加权中值噪声检测算子  34-35
    2.2.2 基于自适应加权中值的双边滤波  35-36
  2.3 实验结果与分析  36-40
  2.4 本章小结  40-41
第三章基于参数形变模型的自动分割方法研究  41-65
  3.1 基于图分割的脑组织粗分割  42-50
    3.1.1 大脑重心的估计  43-45
    3.1.2 吉布斯能量函数  45-46
    3.1.3 图分割离散优化  46-50
  3.2 基于Marching cubes 的初始表面提取  50-53
  3.3 参数形变模型  53-58
    3.3.1 梯度向量流  56-58
  3.4 实验结果与分析  58-64
  3.5 本章小结  64-65
第四章基于嵌入边缘置信度的活动线分割方法  65-83
  4.1 活动线分割方法  66-69
    4.1.1 构造代价函数  67-69
    4.1.2 最优路径的产生  69
  4.2 经典活动线方法性能分析  69-72
  4.3 嵌入边缘置信度  72-74
  4.4 基于嵌入边缘测度的活动线分割  74-76
  4.5 三维扩展  76-77
  4.6 实验结果与分析  77-82
  4.7 本章小结  82-83
第五章基于元胞自动机理论的分割  83-99
  5.1 元胞自动机理论  83-87
    5.1.1 元胞自动机的组成  84-85
    5.1.2 元胞自动机的特点  85-87
  5.2 基于元胞自动机的分割方法  87-91
  5.3 三维扩展  91-92
  5.4 实验结果与分析  92-97
  5.5 本章小结  97-99
第六章基于GPU 加速的医学图像分割  99-112
  6.1 GPU 体系结构概述  100-107
    6.1.1 计算机并行处理原理和体系结构  100-104
    6.1.2 GPU 通用计算的基本方法  104-107
  6.2 元胞自动机分割算法的并行运算分析  107-108
  6.3 元胞自动机分割算法的GPU 实现  108-110
  6.4 算法效率比较  110-111
  6.5 本章小结  111-112
第七章总结与展望  112-115
  7.1 全文工作回顾与总结  112-114
  7.2 未来工作展望  114-115
参考文献  115-123
致谢  123-124
攻读博士学位期间发表、撰写的论文  124

三维医学图像精准分割算法研究

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