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酵母双杂交筛选猪血管内皮细胞中与猪瘟病毒NS2蛋白相互作用的蛋白
作 者: 康恺
导 师: 张彦明
学 校: 西北农林科技大学
专 业: 预防兽医学
关键词: 猪瘟病毒 NS2蛋白 酵母双杂交 猪血管内皮细胞
分类号: S858.28
类 型: 硕士论文
年 份: 2011年
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内容摘要
猪瘟病毒(Classical swine fever virus,CSFV)引起的猪瘟(Classical swine fever, CSF)被世界动物卫生组织(OIE)列为必须上报的动物传染病之一。由于CSFV体外培养增殖滴度低且不引起细胞病变,所以国内外对CSFV的研究大多侧重于病毒的检测以及新型疫苗的研发,而对CSFV的致病机理研究相对较少。NS2蛋白为CSFV的一个非结构蛋白。现有资料表明,NS2蛋白通过与宿主细胞的相互作用对CSFV的复制有一定调节作用,并产生蛋白酶活性,切割NS2-3复合体释放NS3单体,而NS3单体的积聚会使接毒培养的细胞出现细胞病变(CPE)。但是目前对NS2蛋白与宿主细胞的相互作用以及调节病毒RNA复制的机制依然不很清楚。本文以研究NS2蛋白与宿主细胞蛋白相互作用为目标,采用酵母双杂交技术,对CSFV宿主细胞猪血管内皮细胞(SUVEC)中与NS2蛋白相互作用的蛋白进行了筛选。获得了以下研究结果:(1)从pGFP-NS2绿色荧光表达载体中扩增得到NS2基因C末端360 bp的编码区,并构建到pGBKT7-NS2-C360诱饵表达载体中,获得了对酵母细胞无毒性且没有自激活性的pGBKT7诱饵表达载体。(2)成功分离、纯化了猪血管内皮细胞双链cDNA,用来表达猎物文库的融合蛋白。(3)将pGBKT7-NS2-C360载体、双链cDNA、猎物载体pGADT7-Rec共转化酵母感受态细胞,经过筛选获得16个阳性克隆。经PCR、测序、比对分析获得8种与CSFV具有相互作用的已知蛋白,分别为胞质溶胶非特异2肽酶(CNDP2)、热休克蛋白40(Hsp40)、CFTR相关配体(CAL)、E3泛激素连接酶、ATP合成酶6 (ATPase6)、NRAS相关蛋白、细胞凋亡调节基因(MOAP1)和核糖核蛋白H1。本试验筛选得到8种已知蛋白,其中Hsp40蛋白的重复性比较高,且现有资料表明,Hsp40参与调节病毒RNA的复制。所以Hsp40将作为所筛选蛋白进一步研究的重点。
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全文目录
摘要 6-7 ABSTRACT 7-11 文献综述 11-23 第一章 猪瘟病毒NS2 蛋白研究进展 11-15 1.1 NS2 蛋白与猪瘟病毒非致细胞病变型型向致细胞病变型转化 12-13 1.2 猪瘟病毒NS2 蛋白酶作用以及切割NS2-3 复合体 13-14 1.3 NS2 蛋白特性与宿主细胞相互作用研究 14-15 第二章 酵母双杂交系统及发展应用 15-23 2.1 酵母双杂交系统的理论甚础 15-16 2.2 酵母双杂交系统的改进与发展 16-19 2.3 酵母双杂交技术的应用 19-21 2.4 酵母双杂交系统的优点与局限性 21 2.4.1 酵母双杂交系统优点 21 2.4.2 酵母双杂技系统缺点 21 2.5 酵母双杂交技术前景展望 21-23 试验研究 23-46 第三章 诱饵载体pGBKT7-NS2-C360 的构建及鉴定 23-31 3.1 材料 23-25 3.1.1 菌株和质粒 23 3.1.2 试剂及试剂盒 23 3.1.3 培养基及其配制 23-24 3.1.4 主要仪器设备 24-25 3.2 方法 25-27 3.2.1 诱饵载体pGBKT7-NS2-C360 的构建 25-26 3.2.2 重组质粒pGBKT7-NS2-C360 对酵母细胞毒性以及自激活性的检测 26-27 3.3 结果 27-29 3.3.1 PCR 扩增NS2-C360 目的基因 27-28 3.3.2 诱饵质粒pGBKT7-NS2-C360 的酶切分析和PCR 鉴定 28 3.3.3 酵母菌落PCR 鉴定 28-29 3.3.4 诱饵蛋白自激活与毒性检测 29 3.4 讨论 29-30 3.5 小结 30-31 第四章 猪血管内皮细胞双链cDNA 的制备 31-36 4.1 材料 31 4.1.1 细胞 31 4.1.2 试剂与试剂盒 31 4.1.3 仪器设备 31 4.2 方法 31-33 4.2.1 猪血管内皮细胞的复苏与培养 31 4.2.2 细胞总RNA 的提取与纯度分析 31-32 4.2.3 第一链cDNA 合成 32 4.2.4 长距离PCR(LD-PCR)扩增dsDNA 32-33 4.2.5 dsDNA 产物的纯化 33 4.3 结果 33-34 4.3.1 总RNA 的提取 33-34 4.3.2 cDNA 的合成与纯化 34 4.4 讨论 34-35 4.5 小结 35-36 第五章 酵母双杂交筛选与CSFV NS2 蛋白相互作用的蛋白 36-46 5.1 材料 36-37 5.1.1 菌株、质粒 36 5.1.2 试剂及试剂盒 36 5.1.3 培养基及配制 36-37 5.1.4 仪器 37 5.2 方法 37-40 5.2.1 pGBKT7-NS2-C360,pGADT7-Rec,双链cDNA 共转化AH109 37-38 5.2.2 对照菌株的转化 38-39 5.2.3 阳性菌落的筛选与鉴定 39-40 5.2.4 文库质粒的解救与测序 40 5.3 结果 40-43 5.3.1 共转化结果 40-41 5.3.2 阳性克隆筛选结果 41 5.3.3 阳性克隆的鉴定 41-42 5.3.4 测序结果 42-43 5.4 讨论 43-45 5.5 小结 45-46 结论 46-47 参考文献 47-52 附录 52-55 缩略词 55-57 致谢 57-58 作者简介 58
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中图分类: > 农业科学 > 畜牧、动物医学、狩猎、蚕、蜂 > 动物医学(兽医学) > 各种家畜、家禽、野生动物的疾 > 家畜 > 猪
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